More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3600 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  62.93 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  59.73 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  57.19 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  55.84 
 
 		 314 aa  343  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  55.23 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  55.29 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  55.22 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  54.27 
 
 		 314 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  54.61 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  54.61 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  54.27 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  54.64 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  52.22 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  55.82 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  52.9 
 
 		 313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  51.7 
 
 		 311 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  50.34 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  53.14 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  50.85 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  48.33 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  51.03 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  50.86 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  50.86 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  49.32 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  43.38 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  48.97 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  47.08 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  48.45 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  42.18 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  46.92 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  46 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  44.86 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  44.71 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  47.42 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  44.76 
 
 		 358 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  43.19 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  46.74 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  44.52 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  43.64 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  47.08 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  44 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  43.34 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  44.95 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  42.57 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  37.93 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  39.8 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  39.25 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  40.21 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.55 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  34.12 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  33.45 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.42 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  32.89 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  35.14 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  35.14 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.17 
 
 		 323 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  35.76 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  30.51 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  34.15 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  32.26 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  32.34 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  35.12 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.15 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  30.21 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  31.11 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  29.51 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  31.48 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  30.37 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  34.64 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.33 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  30.37 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  29.47 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.42 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  30.07 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  28.37 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  28.37 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  28.37 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  32.66 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  31.51 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  31.72 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>