More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1799 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  64.67 
 
 
329 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  63.49 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  54.75 
 
 
334 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  54.4 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  43.85 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  43.51 
 
 
322 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  43.28 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  42.37 
 
 
329 aa  248  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  235  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  39.67 
 
 
321 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  37.61 
 
 
325 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  38.48 
 
 
325 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  38.48 
 
 
325 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  38.18 
 
 
325 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  38.18 
 
 
325 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  38.18 
 
 
325 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  37.99 
 
 
326 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  38.34 
 
 
325 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  36.06 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  37 
 
 
325 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  38.82 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  38.82 
 
 
326 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  37.78 
 
 
325 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  38.82 
 
 
326 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  36.84 
 
 
323 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  38.16 
 
 
326 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  38.18 
 
 
326 aa  215  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  35.35 
 
 
325 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  38.08 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  38.82 
 
 
326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  39.14 
 
 
327 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  34.45 
 
 
346 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  35.15 
 
 
323 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  36.61 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.74 
 
 
346 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  31.71 
 
 
325 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  34.21 
 
 
327 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  34.7 
 
 
328 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  33.94 
 
 
323 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  33.64 
 
 
325 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  31.99 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  34.24 
 
 
323 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  30.59 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.27 
 
 
326 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  32.33 
 
 
339 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  33 
 
 
311 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  33.43 
 
 
314 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  32.62 
 
 
326 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  32.27 
 
 
324 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  31.19 
 
 
324 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  32.92 
 
 
314 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  33.11 
 
 
313 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.77 
 
 
374 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  32.27 
 
 
315 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  32.21 
 
 
314 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  32.31 
 
 
334 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  29.85 
 
 
329 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.3 
 
 
319 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  30.95 
 
 
332 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  32.17 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  32.17 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  31.56 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  31.53 
 
 
330 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  29.38 
 
 
314 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  35.23 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  28.79 
 
 
328 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.66 
 
 
328 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.56 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  31.61 
 
 
328 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  31.61 
 
 
328 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  31.08 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  31.1 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  31.39 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  28.96 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  32.09 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  30.41 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  31.76 
 
 
319 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  33.78 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  30.74 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  30.89 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29.39 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29.39 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  28.84 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.79 
 
 
322 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  30.41 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  29.39 
 
 
319 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  27.89 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  27.83 
 
 
341 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  30.48 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  27.43 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  27.33 
 
 
326 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>