More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0066 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  60.75 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  56.16 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  53.61 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  55.82 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  54.14 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  54.48 
 
 		 314 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  53.79 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  48.94 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  53.1 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  53.12 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  53.47 
 
 		 314 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  53.08 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  48.56 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  51.72 
 
 		 314 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  51.54 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  50.5 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  46.13 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  51.55 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  44.61 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  45.03 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  47.84 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  43.94 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  43.94 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  43.94 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  48.81 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  51.2 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  47.24 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  42.56 
 
 		 329 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  43.77 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  47.84 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  47.47 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  49.08 
 
 		 323 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  43.79 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  42.96 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  45.17 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  42.06 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  41.55 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  41.03 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  39.66 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  41.78 
 
 		 317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  39.86 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  39.86 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  39.93 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  41.03 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  38.18 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  39.43 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  39.27 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  39.07 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  36.42 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.14 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  34.1 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.86 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  38.38 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.53 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  31.19 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  35.92 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.85 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.35 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  35.21 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  35.21 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  32.66 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  36.12 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.9 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.77 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  31.51 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.8 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  37.38 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  31.86 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.56 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  31.19 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  32.34 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  28.08 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  30.67 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  26.25 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  29.19 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  29.24 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  27.3 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  28.38 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  30.85 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  29.47 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>