More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3313 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  76.58 
 
 		 316 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  72.61 
 
 		 314 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  71.34 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  70.7 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  69.75 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  69.43 
 
 		 313 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  69.43 
 
 		 314 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  68.79 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  57.19 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  59.11 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  55.56 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  55.29 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  53.4 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  49.21 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  53.1 
 
 		 319 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  53.1 
 
 		 319 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  47.56 
 
 		 319 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  50.17 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  48.52 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  49.32 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  49.66 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  51.9 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  48.96 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  47.42 
 
 		 325 aa  281  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  51.57 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  48.98 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  51.65 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  46.58 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  50.35 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  47.77 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  46.74 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  46.21 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  46.94 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  44.14 
 
 		 374 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  41.92 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  44.83 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  40.75 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  42.07 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  42.27 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  41.92 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  41.92 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  38.91 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  40.91 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  38.25 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  43.17 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  40.69 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  40.88 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  39.66 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  37.02 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  36.91 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  34.01 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.94 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.99 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  34.15 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.78 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  34.64 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  35.56 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  30.24 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  33.87 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  30.24 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.47 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  30.24 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  29.9 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  29.9 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  33.33 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  28.84 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30.79 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  34.86 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  34.86 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32.65 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  30.07 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  32.57 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  30.94 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  33.22 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  32.09 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  31.8 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  32.92 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  29.38 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  29.45 
 
 		 331 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  29.5 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  31.15 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  31.15 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  30.23 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  30.82 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  29.84 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  29.51 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  28.95 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  27.53 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  27.53 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>