More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6270 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 342 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  41.54 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  35.41 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  36.79 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  33.67 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  36.45 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  36.81 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  34.92 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  32.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  32.66 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  33.9 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.24 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  33.56 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  34.24 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  31.6 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  31.77 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  32.92 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  31.42 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  31.27 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  32.33 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  31.15 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  32.09 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  28.92 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  34.01 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  32.65 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  29.87 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  30.07 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  30.06 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.06 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  30.06 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  34.82 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  30.13 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  29.79 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29.01 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29.01 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  29.79 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  32.89 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  29.77 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  27.99 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  27.24 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  31.16 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  26.33 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  27.33 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  30.38 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  29.28 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  26.19 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  26.85 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  26.01 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  23.24 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  30.11 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  26.87 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  30.67 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  25.93 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  29.39 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  22.32 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  21.78 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  22.54 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  22.54 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  21.78 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  22.3 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  28.32 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  25.89 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  26 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  22.11 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  25.33 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  25.17 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.1 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  25.17 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  24.67 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  24.67 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  27.04 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  26.22 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  26.22 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  26.22 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  25.87 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  25.87 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  25.87 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  25.59 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  25.87 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  28.23 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  25.79 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  23.67 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  23.99 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  24.1 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  24.32 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  25.89 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  24.37 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  23.57 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  25.83 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>