More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2012 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 341 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  81.23 
 
 		 337 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  63.73 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  62.03 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  43.59 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  40.35 
 
 		 319 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  43.64 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  42.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  39.61 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  39.25 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  39.66 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  40.78 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  40.78 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  40.85 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  38.48 
 
 		 319 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  40.64 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  38.91 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  39.65 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  37.88 
 
 		 319 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  38.95 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  38.65 
 
 		 319 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  37.88 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  39.02 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  37.15 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  39.13 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  39.04 
 
 		 325 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  36.11 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  36.03 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  39.52 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  36.77 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  34.63 
 
 		 325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  39.71 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  38.15 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  36.19 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  36.96 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  33.75 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  31.64 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  31.06 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  35.02 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.88 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  31.16 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  28.77 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  29.35 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.16 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  27.9 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  28.83 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  29.64 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.07 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  30.07 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  30.07 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  28.83 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  28.06 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  28.83 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  28.36 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  31 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.38 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  28.72 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  25.6 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.15 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.76 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  29.13 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  28.34 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  28.34 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.05 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  29.29 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.95 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.05 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  28.84 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  26.24 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  26.5 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  27.42 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  26.24 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  29.32 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  29.58 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  28.41 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.12 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  25.94 
 
 		 322 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  25.75 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  28.12 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  27.98 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  29.12 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  26.99 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  26.32 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>