More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1237 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  81.23 
 
 		 341 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  65.77 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  61.02 
 
 		 319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  38.77 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  44 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  40.66 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  40.77 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  42.96 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  40.78 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  40.78 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  40.78 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  41.34 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  41.39 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  40.14 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  40.64 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  39.3 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  37.94 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  38.25 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  38.6 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  37.38 
 
 		 314 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  39.27 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  36.88 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  38.55 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  37.12 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  37.98 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  35.74 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  38.14 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  36.76 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  37.96 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  39.27 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  31.83 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  36.64 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  37.78 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  36.94 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  35.74 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  36.96 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  32.36 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  32.82 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  32.3 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  30.5 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  35.15 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  29.88 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  30.93 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  32.5 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  32.41 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  32.41 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  32.41 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  30.1 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  29.39 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  28.27 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  26.98 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  26.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  27.6 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  26.26 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.35 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  29.31 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  27.53 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  28.41 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  26.06 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  27.14 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.2 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  28.1 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  26.77 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  26.77 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  26.73 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  25 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  28.27 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  25.62 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  24.83 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  24.91 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  30.04 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  30.71 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  25.26 
 
 		 322 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  29.86 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  28.51 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  25.56 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  25.72 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  25.28 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  24.63 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  28.08 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  24.63 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  25.42 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  29.73 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>