More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1420 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  98.73 
 
 		 314 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  73.89 
 
 		 314 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  75.48 
 
 		 313 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  70.7 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  70.38 
 
 		 314 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  72.78 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  70.06 
 
 		 314 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  69.43 
 
 		 314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  58.08 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  54.61 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  55.97 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  54.95 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  54.76 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  54.17 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  51.9 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  48.24 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  44.7 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  46.39 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  47.75 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  48.97 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  48.44 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  48.44 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  48.52 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  47.2 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  51.65 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  46.58 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  47.06 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  45.17 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  46.6 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  47.24 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  47.12 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  46.23 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  44.14 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  45.72 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  45.58 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  44.64 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  45.17 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  43.1 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  42.76 
 
 		 328 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  42.76 
 
 		 328 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  44.48 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  43.6 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  41.55 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  43.09 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  38.43 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  36.05 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  39.78 
 
 		 358 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  41.03 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  39.1 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  38.73 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  38.54 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  37.29 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  36.33 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  36.42 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  36.1 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  34.7 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  35.37 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.38 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  36.82 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  34.46 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.78 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  36.43 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  35.05 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  36.84 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  34.95 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  40.51 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  35.14 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  34.01 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  34.02 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  35.65 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  34.45 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  35.23 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  34.81 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  40.08 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  34.81 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  34.95 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  34.95 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  33.78 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  33.78 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  34.47 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  30.69 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  29.84 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  33.45 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  33.11 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.85 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  31.01 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  31.01 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  31.94 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  31.56 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>