More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3342 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  81.9 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  81.9 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  81.6 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  81.9 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  81.6 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  76.38 
 
 		 325 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  74.69 
 
 		 323 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  59.82 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  62.46 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  62.54 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  59.08 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  62.54 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  62.54 
 
 		 326 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  61.54 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  57.23 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  58.02 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  62.21 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  61.79 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  62.21 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  59.6 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  52.45 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  53.63 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  53.97 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  50 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  49.85 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  51.53 
 
 		 329 aa  331  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  52.4 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  47.4 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  42.99 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  46.46 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  40.67 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  40.2 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  40 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  37.85 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  37.3 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  37.12 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  33.64 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  34.92 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  33.55 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  33.03 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  32.63 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  34.04 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  35.5 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  30.79 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.77 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.44 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  33.45 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  30.64 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  31.77 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.76 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.02 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.76 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.72 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.24 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  33.96 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  28.52 
 
 		 374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.18 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  29.25 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  29.23 
 
 		 329 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  28.7 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  28.75 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  29.33 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  28.62 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  30.56 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  32.85 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.68 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  29 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  29 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.49 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29.45 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.56 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29.45 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  29.77 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.28 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.28 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  29.09 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  27.88 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.59 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  30.74 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  30.94 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  28.52 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.49 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.9 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  26.46 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  29.47 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  29.9 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  31.25 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  27.78 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  28.47 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  28.27 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  31.8 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  26.57 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  26.57 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  28.18 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>