More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  78.64 
 
 		 325 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  66.14 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  70.07 
 
 		 327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  65.89 
 
 		 326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  66.23 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  66.23 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  64.8 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  64.49 
 
 		 325 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  67.22 
 
 		 326 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  65.56 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  67.22 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  57.41 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  56.44 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  54.94 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  54.63 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  54.63 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  54.94 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  54.63 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  55.66 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  53.16 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  56.29 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  50.17 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  49.17 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  45.37 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  48.99 
 
 		 323 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  45.79 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  50.51 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  45.08 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  42.11 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  40.19 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  38.03 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  36.88 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.89 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.71 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  33.56 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  33.11 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  30.06 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  34.31 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  28.1 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.15 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.21 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.64 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.64 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  28.86 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  28.18 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  28.04 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  27.87 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  28.04 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.35 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  31.08 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  26.56 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  28.85 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  26.61 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  26.56 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  27.36 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  29.43 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  23.75 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  29.43 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  27.88 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  28.53 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  28.03 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  23.75 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  27.52 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  24.08 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  29.1 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.08 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  22.81 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  23.41 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  25.62 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  27.36 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  22.82 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  25.39 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  25.34 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  26.1 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  27.34 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  27.3 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  27.5 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  28.79 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  28.38 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  28.24 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  28.91 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  29.85 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  26.56 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  31.31 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  26.48 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  27.99 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  26.48 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  28.87 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  24.44 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  33.17 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  26.44 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>