More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3051 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  66.57 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  54.79 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  54.55 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  50.3 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  52.8 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  49.4 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  48.22 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  50.32 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  51.76 
 
 		 349 aa  352  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  42.43 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  42.95 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  43.46 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  40.8 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.86 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.93 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  30.56 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.07 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  29.34 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  28.24 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  28.27 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  27.76 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.43 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  28.31 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  29.43 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  29.72 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  31.12 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  26.94 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  27.73 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  30.19 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  27.57 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  27.3 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  28.26 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  30.56 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  30.67 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  26.95 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  26.63 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  29.85 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  30.19 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  27.51 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  27.06 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  28.61 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  28.94 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  28.33 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  28.01 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  29 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  28.14 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  30.46 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  29.91 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  27.78 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  31.73 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  27.81 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  28.21 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  27.3 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  29.63 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  28.92 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  27.57 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  28.12 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  31.63 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3515  hypothetical protein  30.29 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327733  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  24.76 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  28.96 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  26.89 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  29.86 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  27.12 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  28.1 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  28.71 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  28.94 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  27.51 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  31.7 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  25.88 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  28.71 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.29 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  27.54 
 
 		 323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  28.03 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  29 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.05 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  25.88 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  25.88 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  28.33 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  28.12 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  27.93 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  31.14 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>