More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0154 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  62.26 
 
 
325 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  60.99 
 
 
325 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  60.99 
 
 
325 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  61.3 
 
 
325 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  60.99 
 
 
325 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  61.3 
 
 
325 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  62.21 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  57.59 
 
 
325 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  61 
 
 
323 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  61.2 
 
 
326 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  58.81 
 
 
325 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  57.59 
 
 
325 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  57.59 
 
 
325 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  61.2 
 
 
326 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  60.2 
 
 
326 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  60.87 
 
 
326 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  60.2 
 
 
326 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  61.51 
 
 
327 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  60.54 
 
 
327 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  54.46 
 
 
325 aa  359  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  54.3 
 
 
329 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  54.52 
 
 
346 aa  346  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  55.33 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  53.33 
 
 
321 aa  335  5e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  49.85 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  50.84 
 
 
325 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  52.4 
 
 
323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  52.24 
 
 
311 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  46.94 
 
 
349 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  50.51 
 
 
339 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  43.29 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  40.94 
 
 
321 aa  245  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  41.8 
 
 
334 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  37.23 
 
 
330 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  38.18 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  40.27 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  36.42 
 
 
327 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  32.52 
 
 
331 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.76 
 
 
346 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  34.56 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  35.88 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  35.26 
 
 
332 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  31.91 
 
 
330 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.81 
 
 
314 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.89 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.47 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.75 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  31.03 
 
 
329 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  30.25 
 
 
314 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.85 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  31.06 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  31.03 
 
 
316 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  31.74 
 
 
328 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  29.43 
 
 
374 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.81 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  32.54 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  29.83 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  30.85 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  30.85 
 
 
314 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  30.77 
 
 
311 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  28.09 
 
 
319 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  31.13 
 
 
326 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.87 
 
 
322 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.87 
 
 
322 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  27.61 
 
 
334 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.45 
 
 
314 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  29.17 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  31.44 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  27.84 
 
 
332 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  33.1 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  30.25 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  29.81 
 
 
319 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  27.83 
 
 
325 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  28.37 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  28.37 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  29.35 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  31.03 
 
 
335 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  31.52 
 
 
324 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  29.35 
 
 
319 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  29.63 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  28.18 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  31.88 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  25.39 
 
 
323 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  28.67 
 
 
319 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  28.67 
 
 
319 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.33 
 
 
336 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  27.3 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  29.63 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>