More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2224 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  93.98 
 
 		 332 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  668    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  36.92 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.26 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  31.43 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  30.46 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  30.67 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  35.11 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  35.28 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  34.97 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  31.55 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.99 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  34.29 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.76 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  35.14 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  30.67 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  32.19 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  35.88 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  32.65 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  33.67 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  32.68 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  34.58 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  33.11 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.5 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.01 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.58 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  32.31 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  34.94 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  32.77 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  30.72 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.28 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  32.89 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.01 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.29 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  31.34 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  31.31 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  30.63 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  29.85 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  27.08 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  34.52 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  34.52 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  32.23 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  28.67 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  32.65 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  28.88 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.38 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  33.81 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  33.81 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  29.57 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  34.16 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  34.16 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  30.52 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  28.67 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  30.52 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  30.52 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  34.34 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  31.65 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  31.86 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  33.57 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  33.57 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  33.96 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  33.57 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  32.88 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  27.3 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  33.21 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  33.21 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  30.51 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  28.12 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  28.62 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  27.27 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  32.74 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  34.75 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  28.63 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  32.03 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  28.96 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  30.82 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  32.03 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  31.29 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  25.53 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  28.85 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  28.53 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  28.1 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>