More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0361 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  73.74 
 
 		 323 aa  424  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  61.99 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  55.22 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  51.4 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  51.1 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  49.21 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  50.16 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  49.84 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  50.84 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  51.2 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  48.6 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  46.15 
 
 		 324 aa  286  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  49.14 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  49.14 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  43.38 
 
 		 325 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  48.97 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  45.21 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  45.52 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  47.42 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  41.3 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  43.3 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  38.61 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  43.3 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  41.03 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  41.03 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  39.66 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  41.24 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  42.27 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  40.21 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  40.69 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  40.75 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  40.75 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  38.36 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  36.88 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  38.67 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  40.34 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  36.05 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  36.64 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  36.99 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  38.83 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  38.14 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  36.77 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  36.53 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  36.53 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  35.99 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  37.3 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  36.52 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  37.07 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  36.73 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.67 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  33.02 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  30.96 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.1 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.72 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  31.71 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  35.45 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  35.35 
 
 		 332 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.63 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  29.94 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.99 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.67 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.67 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.67 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  32.03 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  32.03 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  32.03 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.67 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  31.67 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  31.67 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  33.78 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  30.33 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  27.7 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  27.7 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  31.42 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  27.8 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  28.2 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.33 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.46 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.64 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  25.9 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  29.08 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  30.41 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.13 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  29.15 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  27.99 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  27.05 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  27.15 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  28.66 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  26.69 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  26.89 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  28.72 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>