More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3004 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  88.62 
 
 		 334 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  75.3 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  75.3 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  75.3 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  57.49 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  62.41 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  56.9 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  54.55 
 
 		 329 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  49.85 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  47.08 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  47.26 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  50.17 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  45.17 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  45.21 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  45.17 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  45.17 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  45.17 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  41.96 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  44.71 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  43.3 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  42.41 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  40.12 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  41.46 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  40.43 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  40.25 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  44.56 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  39.2 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  40.75 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  38.98 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  39 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  38.18 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  34.57 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  36.64 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  36.64 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  37.33 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  36.3 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  36.43 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  38.32 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  35.27 
 
 		 319 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  36.64 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  36.08 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  34.39 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  35.89 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  34.59 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  35.35 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  35.59 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  34.78 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.77 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  30.86 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  31.08 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  31.91 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  31.74 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  33.54 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  33.11 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32.42 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.06 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  31.99 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.09 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  31.14 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.34 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  30.43 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  32.08 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.29 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  28.04 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.7 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.4 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  29.36 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.29 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  30.99 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  30.99 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  31.44 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  30.22 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  30.96 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  26.98 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.65 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  32.34 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  32.34 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  27.09 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  32.34 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  27.3 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  32.34 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  32.34 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  27.3 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  32.19 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  29.02 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  30 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>