More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2117 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  40.81 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  32.69 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  36.8 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  35.87 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  34 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  34.34 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  33.11 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  30.58 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  33.87 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  36.4 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  32.19 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.67 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  34 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  32.04 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  32 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  31.85 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  32.42 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  31.48 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.17 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.96 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  31.79 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  33.04 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  33.04 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  31.74 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  38.65 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  32.17 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  32.78 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  34.14 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  32.61 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  31.93 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.89 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.93 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  31.73 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  31.3 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  32.26 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  30.89 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  30.89 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  31.28 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  32.3 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  32.13 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  31.51 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  29.11 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  30.77 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  27.74 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  26.42 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  29.72 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.8 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.41 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  26.98 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  29.25 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  30.82 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  28.4 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  29.06 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  27.71 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  25.61 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  25.75 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.13 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  21.91 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  26.48 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  24.7 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  25.89 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  25.23 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  27.24 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  25.45 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  26.69 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  25.88 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  26.67 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  25 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  28.1 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  27.2 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  27.2 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  27.69 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  25.08 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  25.47 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  25.47 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  25.47 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  25.09 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  25.09 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  25.09 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  26.64 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  25.84 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  27.45 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  24.62 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  24.7 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  27.88 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  26.64 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  24.77 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  25.86 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  28.71 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  24.46 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>