More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3440 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  56.52 
 
 
311 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  56.6 
 
 
314 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  56.6 
 
 
314 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  59.11 
 
 
314 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  59.66 
 
 
314 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  53.54 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  57.24 
 
 
314 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  58.08 
 
 
314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  57.24 
 
 
313 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  57.73 
 
 
314 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  53.77 
 
 
315 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  52.22 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  51.88 
 
 
328 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  51.03 
 
 
322 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  51.88 
 
 
345 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  50.17 
 
 
325 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  46.15 
 
 
323 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  45.57 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  48.98 
 
 
322 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  49.83 
 
 
319 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  49.83 
 
 
319 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  45.28 
 
 
328 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  47.1 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  48.8 
 
 
319 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  46.92 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  47.6 
 
 
319 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  45.48 
 
 
319 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  43.58 
 
 
325 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  46.89 
 
 
323 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  44.27 
 
 
329 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  42.36 
 
 
332 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  41.82 
 
 
334 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  43.17 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  45.21 
 
 
319 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  46.08 
 
 
330 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  43.15 
 
 
374 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  46.39 
 
 
319 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  43.39 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  43.05 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  45.27 
 
 
317 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  40.5 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  39.55 
 
 
329 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  37.04 
 
 
338 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  36.79 
 
 
341 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  35.74 
 
 
337 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  36.21 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  37.76 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  36.77 
 
 
319 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  36.43 
 
 
333 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  35.47 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  34.24 
 
 
326 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  33.11 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  33.44 
 
 
335 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  33.11 
 
 
323 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.15 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  35.71 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  31.42 
 
 
330 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  31.87 
 
 
332 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  34.8 
 
 
326 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  31.67 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  33.9 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.19 
 
 
330 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  33.56 
 
 
322 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  31.46 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  31.67 
 
 
321 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  32.45 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.79 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.79 
 
 
334 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  31.49 
 
 
336 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  34.57 
 
 
320 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  26.54 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  26.25 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.18 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  32.57 
 
 
321 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  26.4 
 
 
343 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  26.21 
 
 
348 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  26.21 
 
 
325 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  29.61 
 
 
325 aa  136  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  25.7 
 
 
324 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.54 
 
 
323 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  25.62 
 
 
322 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  30.89 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  29.38 
 
 
326 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  29.01 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  29.01 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  27.91 
 
 
331 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>