More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0873 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  98.74 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  98.74 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  98.74 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  98.74 
 
 		 317 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  54.46 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  55.78 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  52.01 
 
 		 323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  55.1 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  54.39 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  54.61 
 
 		 326 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  53.09 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  52.9 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  36.76 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  37.92 
 
 		 346 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  34.24 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  34.12 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.48 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  32.53 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  31.85 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  30.95 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  31.43 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  32.52 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.2 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.16 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.4 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  32.19 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  30.38 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  31.31 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  30.79 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  32.54 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  30.79 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  30.67 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  31.66 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  32.08 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.86 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  34.22 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  33.22 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  32.99 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.73 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  32.33 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  33.23 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  29.97 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  29.02 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  28.47 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.34 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  30.27 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.34 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.34 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  27.22 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  30.6 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  31.14 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  30.63 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  29.58 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  30.23 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  28.96 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  29.37 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  32.31 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  29.06 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  31.19 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  29.5 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  29.8 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  26.37 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  25.25 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  25 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  25.42 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  29.05 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  30.77 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  27.3 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  28.96 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  25.75 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  25.75 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  30.2 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  28.53 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  29.29 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  29.29 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  30.07 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  28.33 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  28.67 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  28.67 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  28.67 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  27.36 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  28.33 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  28.62 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  28.4 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>