More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2824 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  647    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  85.43 
 
 		 322 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  46.94 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  43.04 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  40.51 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  42.59 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  40.2 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  41.3 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  43.58 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  42.19 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  40.99 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  40.99 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  40.68 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  36.51 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  41.53 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  38.17 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  40.19 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  40.94 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  41.53 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  41.72 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  36.45 
 
 		 325 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  36.45 
 
 		 325 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  36.45 
 
 		 325 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  36.14 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  36.14 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  40.13 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  36.67 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  42.19 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  41.53 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  43.1 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  35.22 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  38.32 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  37.09 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  36.03 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  34.23 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  37.2 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  34.29 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  36.7 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  31.35 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  33 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.41 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.3 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.31 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  33.2 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  32.08 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  32.5 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  32.19 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  32.19 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.09 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  30.85 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  31.06 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32.23 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.21 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  31.63 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  31.32 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  32.14 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  30.64 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  31.97 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.24 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.24 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  30.95 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.24 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.54 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  29.49 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  30.74 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  33.56 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  32.31 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  32.23 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  31.42 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  30.74 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  32.31 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  33.56 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  27.73 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  31.27 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  30.93 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.04 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.51 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  30.03 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  30.79 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  30.07 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.72 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  32.01 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  30.58 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  30.43 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>