More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3196 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  47.6 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  28.47 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  27.89 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  28.52 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  28.2 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  29.9 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  28.01 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  27.7 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  27.83 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.19 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  25.39 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.49 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  27.89 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  30.07 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  28.19 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  25.77 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.35 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  29.53 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  26.99 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  28.19 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  28.04 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  26.79 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  28.19 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  30.26 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  28.19 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  28.07 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  29.59 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  27.95 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  27.56 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  28.02 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  29.02 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  27.44 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  24.39 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  29.27 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  26.25 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  28.4 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  30.6 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  28.67 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  29.83 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.99 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  27.96 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  29.47 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.32 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  27.04 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  28.76 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  28.76 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  28.76 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  26.1 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  26.91 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  26.65 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  28.43 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  28.43 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  30.43 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  31.14 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  27.21 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  31.09 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  26.94 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.39 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  28.22 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  28.22 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.26 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  26.87 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  25.42 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  28.67 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  29.24 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  27.81 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  27.99 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  27.11 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  29.01 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  27.61 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  25.53 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  30.14 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  25.52 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  26.49 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0889  hypothetical protein  28.67 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  25.4 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  24.16 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  28.87 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  29 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  25.52 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  25.16 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  25.52 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  27.21 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  25.94 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  28.69 
 
 		 327 aa  92.8  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  25.52 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  26.81 
 
 		 327 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>