102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1100 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1100  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 176 aa  355  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.327334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0952  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.422759  hitchhiker  0.0019689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  31.85 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.88 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  28.76 
 
 		 772 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  23.9 
 
 		 738 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  31.01 
 
 		 646 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  38.89 
 
 		 238 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 641 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 233 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  24.53 
 
 		 860 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  35.53 
 
 		 651 aa  51.2  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  28.07 
 
 		 528 aa  51.2  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 646 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  38.57 
 
 		 308 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.43 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  26.04 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  25.9 
 
 		 447 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 231 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.25 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 512 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.43 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  32.04 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  33.7 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  25.35 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29.1 
 
 		 594 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 		 487 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.16 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  25.2 
 
 		 243 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  25.34 
 
 		 721 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  23.62 
 
 		 584 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0636  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.17 
 
 		 1018 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 624 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 419 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  24.66 
 
 		 721 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0419  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.62 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 177 aa  42  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.21 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 		 236 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0411  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 209 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.83 
 
 		 238 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 238 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.5 
 
 		 238 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00758  putative transcriptional regulator (Crp family) protein  24.66 
 
 		 223 aa  41.2  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.72 
 
 		 1018 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4082  cyclic nucleotide-binding  26.83 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 		 231 aa  41.2  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.06 
 
 		 225 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 234 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  26.92 
 
 		 231 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>