78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1803 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0952  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.422759  hitchhiker  0.0019689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  28.44 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  30.95 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1100  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.327334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  30.95 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 444 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2726  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  25.78 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 512 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.62 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  36.84 
 
 		 449 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  28.87 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  32.71 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.2 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  27.27 
 
 		 738 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  34.18 
 
 		 441 aa  48.9  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 493 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  22.83 
 
 		 637 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  21.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25387  predicted protein  30.43 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000120212  hitchhiker  0.00607108 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  26.85 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  27.27 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  26.96 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  27.69 
 
 		 868 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.45 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  28.09 
 
 		 454 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 858 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 164 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 		 417 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  32.71 
 
 		 124 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  27.84 
 
 		 923 aa  45.4  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  26.25 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 948 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  32.63 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  28.03 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  29.89 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  29.67 
 
 		 454 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  28.03 
 
 		 721 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 503 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  31.87 
 
 		 620 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.73 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  28.26 
 
 		 482 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.75 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.16 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  26.85 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 413 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.67 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  24.6 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>