111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0629 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1112    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  43.73 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.07 
 
 		 560 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  41.65 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  41.46 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 		 551 aa  210  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 		 622 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  32.77 
 
 		 620 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.36 
 
 		 536 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.47 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.87 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.26 
 
 		 577 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.61 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  23.23 
 
 		 961 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  24.56 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  24.56 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  22.69 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  25.15 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.48 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  24.12 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  22.44 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  22.44 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  28.05 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  27.01 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  20.61 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  23.1 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.49 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  21.36 
 
 		 543 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  23.82 
 
 		 356 aa  53.9  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  23.12 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.28 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  29.45 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  23.22 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  29.85 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  30.6 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  23.6 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.3 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  30.28 
 
 		 176 aa  50.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  22.53 
 
 		 446 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  33.67 
 
 		 180 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  29.85 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  23.56 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.84 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  22.8 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  25.53 
 
 		 177 aa  48.5  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0692  cardiolipin synthase  21.72 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176026  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  22.16 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  23.86 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.7 
 
 		 242 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.91 
 
 		 207 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  26.76 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  26.75 
 
 		 190 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.73 
 
 		 196 aa  47.4  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  27.66 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  32.08 
 
 		 400 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2987  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.54 
 
 		 349 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.94 
 
 		 527 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 223 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.7 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  22.16 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  33.66 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  33.93 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  28.47 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.91 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  22.99 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  29.17 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  33.67 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  29.68 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.82 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  21.39 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  32.17 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  32.67 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  30.51 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  27.14 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.91 
 
 		 207 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  28.31 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.09 
 
 		 196 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  27.56 
 
 		 162 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.91 
 
 		 242 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  29.29 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  26.14 
 
 		 188 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  26.76 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  26.58 
 
 		 538 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  33.04 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 		 192 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  31.13 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  28.39 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  22.34 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  31.43 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  31.43 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  31.43 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  31.43 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  31.43 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>