133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2376 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  100 
 
 
223 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  89.86 
 
 
223 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  68.47 
 
 
245 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  67.98 
 
 
242 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  67.49 
 
 
207 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  70.81 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  71.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  70.81 
 
 
242 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  70.81 
 
 
207 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  58.76 
 
 
180 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  56.95 
 
 
183 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  56.29 
 
 
169 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  55.97 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  53.38 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  53.05 
 
 
176 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  46.41 
 
 
205 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  41.62 
 
 
193 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  45.93 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  42.53 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  42.03 
 
 
177 aa  121  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  39.13 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.13 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  39.87 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  37.06 
 
 
758 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  35.54 
 
 
234 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  35.86 
 
 
176 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  36.13 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  39.19 
 
 
189 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  42.06 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  36.48 
 
 
189 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  36.48 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  36.36 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  36.36 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.25 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  33.73 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  31.82 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  32.54 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.14 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  35.53 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  37.75 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  28.96 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  40 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  32.24 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.53 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.73 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.77 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  30.15 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  31.67 
 
 
359 aa  64.3  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.15 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  29.86 
 
 
481 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  33.6 
 
 
392 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  28.03 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 
487 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
393 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  26.35 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  27.23 
 
 
467 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  32.58 
 
 
299 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.47 
 
 
484 aa  55.5  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  27.21 
 
 
376 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  33.67 
 
 
180 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.19 
 
 
536 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  30.14 
 
 
620 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  26.92 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 
622 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.8 
 
 
389 aa  53.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  26.39 
 
 
286 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  30.83 
 
 
299 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25.83 
 
 
286 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  30.83 
 
 
299 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  27.65 
 
 
545 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  30.3 
 
 
448 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  30.82 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.37 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  27.06 
 
 
545 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  33.67 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  27.72 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3119  hypothetical protein  28.91 
 
 
383 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274638  hitchhiker  0.00609959 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7368  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  48.84 
 
 
52 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.44 
 
 
585 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  31.47 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  26.43 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 
551 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  50 
 
 
575 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  33.66 
 
 
550 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  29.45 
 
 
404 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  28.57 
 
 
394 aa  45.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.56 
 
 
477 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.59 
 
 
586 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 
528 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  29.55 
 
 
446 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>