240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0126 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  100 
 
 
175 aa  356  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  54.37 
 
 
162 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  53.1 
 
 
177 aa  167  9e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  49.06 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  49.06 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  49.06 
 
 
207 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  48.43 
 
 
242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  49.06 
 
 
242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  48.43 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  48.43 
 
 
245 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  42.11 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  47.9 
 
 
758 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  41.52 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  43.11 
 
 
223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  42.53 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  44.38 
 
 
176 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  40.22 
 
 
180 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  37.21 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  45.26 
 
 
234 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  36.69 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.26 
 
 
213 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  39.26 
 
 
213 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40.99 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.43 
 
 
229 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.73 
 
 
196 aa  107  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  39.38 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  42.22 
 
 
184 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  38.95 
 
 
184 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  45.6 
 
 
176 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  45.6 
 
 
176 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40.36 
 
 
205 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  33.94 
 
 
176 aa  100  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.8 
 
 
203 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.65 
 
 
252 aa  97.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  37.16 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  35.04 
 
 
230 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  35.77 
 
 
230 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  35.93 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  40.15 
 
 
404 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.19 
 
 
386 aa  91.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  35.88 
 
 
194 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  38.03 
 
 
208 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  37.04 
 
 
203 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  32.41 
 
 
234 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  36.25 
 
 
189 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.83 
 
 
363 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  36.14 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  36.42 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  37.16 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  37.88 
 
 
376 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  40.46 
 
 
393 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.06 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  39.42 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  32.92 
 
 
260 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  32.1 
 
 
392 aa  81.3  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  31.68 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.41 
 
 
484 aa  77.8  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  33.12 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  30.27 
 
 
487 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.41 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 
472 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  31.54 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  31.39 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.8 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  29.03 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  29.03 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  29.89 
 
 
543 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  29.05 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  30.86 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.39 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  32.17 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.9 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  30.17 
 
 
528 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  35.46 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  35.46 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  35.46 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  35.46 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  30.83 
 
 
300 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  35.46 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  27.91 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  35.46 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.39 
 
 
366 aa  58.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.11 
 
 
545 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  39.13 
 
 
210 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.27 
 
 
585 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  35.59 
 
 
476 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.88 
 
 
355 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  35.07 
 
 
575 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  23.7 
 
 
394 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.09 
 
 
374 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>