143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02951 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  96.11 
 
 
467 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  64.62 
 
 
472 aa  357  7e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  47.49 
 
 
479 aa  248  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  46.69 
 
 
545 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  46.3 
 
 
545 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.15 
 
 
585 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.35 
 
 
545 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  45.74 
 
 
543 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  45.74 
 
 
528 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02891  hypothetical protein  96 
 
 
75 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.294183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  37.87 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 
487 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.19 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.17 
 
 
196 aa  82  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.92 
 
 
175 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02781  hypothetical protein  80.95 
 
 
56 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.28 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  27.75 
 
 
177 aa  67  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  28.97 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  25.42 
 
 
392 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  26.21 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  30.06 
 
 
176 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  30.06 
 
 
176 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.32 
 
 
376 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  26.45 
 
 
151 aa  62.4  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  24.28 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  26.83 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  23.97 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  27.22 
 
 
311 aa  58.9  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.85 
 
 
536 aa  58.9  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  28.96 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  30.73 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  27.61 
 
 
359 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  23.98 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  28.4 
 
 
448 aa  56.2  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  26.97 
 
 
176 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  25.43 
 
 
575 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  25.95 
 
 
203 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.67 
 
 
363 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  26.92 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.58 
 
 
590 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.66 
 
 
386 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  22.73 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  26.79 
 
 
439 aa  51.6  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.74 
 
 
591 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.06 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  26.67 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  36.26 
 
 
558 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  45.28 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  23.18 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  21.93 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  25.51 
 
 
613 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.47 
 
 
205 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  26.42 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  26.16 
 
 
540 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  26.47 
 
 
758 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
601 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  24.14 
 
 
183 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.59 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.18 
 
 
484 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  23.29 
 
 
389 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  53.66 
 
 
553 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.32 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 
598 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  27.14 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  23.98 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  53.66 
 
 
550 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  53.66 
 
 
595 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.17 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.25 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  26.25 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  53.66 
 
 
550 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  53.66 
 
 
550 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  53.66 
 
 
550 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  50 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  53.66 
 
 
550 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  51.16 
 
 
549 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  24.14 
 
 
169 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  50 
 
 
541 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  25.58 
 
 
540 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 
203 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  27.38 
 
 
507 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  33.33 
 
 
529 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  25.53 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.62 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.62 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.62 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  25.53 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  23.29 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  24.44 
 
 
601 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>