117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06501 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  43.1 
 
 
229 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  44.21 
 
 
230 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  44.21 
 
 
230 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.41 
 
 
175 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  31.97 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  29.63 
 
 
177 aa  82  0.000000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  35.51 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.2 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  31.06 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  24.22 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  27.48 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.33 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.88 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.29 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  31.9 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  31.9 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.91 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  26.17 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  27.15 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.48 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.48 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  28.68 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  27.4 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  29.94 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.49 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  28.4 
 
 
543 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.87 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.87 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.29 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.87 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.87 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  27.52 
 
 
359 aa  62.8  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  28.99 
 
 
393 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
484 aa  63.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  31.09 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  29.71 
 
 
193 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  27.34 
 
 
176 aa  61.6  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  27.34 
 
 
176 aa  61.6  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  29.41 
 
 
392 aa  62  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  27.46 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  24.86 
 
 
528 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  26.32 
 
 
545 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.87 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.22 
 
 
545 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  23.29 
 
 
467 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  28.15 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  28.15 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  26.43 
 
 
183 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  26.35 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  25.66 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  23.97 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  26.06 
 
 
176 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25.6 
 
 
545 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  30.43 
 
 
758 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  24.49 
 
 
169 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  24.49 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.12 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  28.23 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 
479 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  32.58 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  27.08 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 
472 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  25.36 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3602  phospholipase D/transphosphatidylase  32.43 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0836596  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  24.29 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  29.13 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25 
 
 
585 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  29.01 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  22.6 
 
 
487 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 
191 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  28.35 
 
 
188 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.94 
 
 
481 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.42 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  26.61 
 
 
389 aa  48.5  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  24.26 
 
 
300 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.43 
 
 
203 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  22.35 
 
 
598 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  22.16 
 
 
598 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  22.16 
 
 
598 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  25.87 
 
 
299 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  25.87 
 
 
299 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.18 
 
 
536 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  24.34 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.26 
 
 
349 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 
471 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  20.45 
 
 
591 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>