94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0711 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
294 aa  587  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  48.57 
 
 
282 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  41.94 
 
 
286 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  41.01 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.11 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  27.34 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  27.14 
 
 
545 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.79 
 
 
545 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  21.51 
 
 
487 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  23.3 
 
 
404 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.72 
 
 
366 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.21 
 
 
545 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  23.76 
 
 
467 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  22.6 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  21.99 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  20.7 
 
 
481 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  28.79 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  33.83 
 
 
177 aa  57  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  32.58 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  28.79 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  32.5 
 
 
208 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.79 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  26.89 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.16 
 
 
196 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  26.89 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.83 
 
 
528 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  27.87 
 
 
189 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  32.54 
 
 
176 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  32.54 
 
 
176 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.89 
 
 
175 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.72 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.15 
 
 
386 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  22.58 
 
 
543 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  25.68 
 
 
439 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  29.82 
 
 
758 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.36 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  29.13 
 
 
184 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.39 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  22.92 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  27.33 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.58 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  18.96 
 
 
620 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  20.61 
 
 
392 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  28.68 
 
 
463 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  26.72 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  26.35 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.46 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  29.25 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  28.93 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.53 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  28.48 
 
 
479 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  27.13 
 
 
223 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.57 
 
 
586 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  30.51 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.95 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  26.96 
 
 
183 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  22.94 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.38 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.93 
 
 
622 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.95 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  25.86 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  28.89 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.68 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.19 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.19 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.91 
 
 
430 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.06 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  25 
 
 
502 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.93 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  22.7 
 
 
180 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  25.64 
 
 
483 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  23.61 
 
 
176 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.12 
 
 
193 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  27.27 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.66 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.29 
 
 
509 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  25.36 
 
 
483 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  27.69 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  28.33 
 
 
151 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  28.37 
 
 
479 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  28.37 
 
 
479 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  28.37 
 
 
479 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.83 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.31 
 
 
198 aa  42.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  23.17 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>