252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2958 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
404 aa  831    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.16 
 
 
386 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  45.85 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  46.44 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.12 
 
 
363 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  31.4 
 
 
392 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  28.54 
 
 
545 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  28.03 
 
 
545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  39.58 
 
 
184 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.82 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  26.12 
 
 
481 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.19 
 
 
467 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  26.4 
 
 
543 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.12 
 
 
229 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  25.26 
 
 
479 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  39.29 
 
 
176 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  39.29 
 
 
176 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  31.41 
 
 
176 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 
487 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.54 
 
 
176 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.63 
 
 
545 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  40.15 
 
 
175 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.31 
 
 
196 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  30.66 
 
 
230 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.66 
 
 
230 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  33.53 
 
 
176 aa  89  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  32.19 
 
 
169 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  34.9 
 
 
184 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  33.8 
 
 
177 aa  89.4  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.62 
 
 
196 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  36.03 
 
 
203 aa  89  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.66 
 
 
198 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.54 
 
 
213 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  33.33 
 
 
193 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.54 
 
 
213 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  31.51 
 
 
183 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  33.72 
 
 
219 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  24.88 
 
 
585 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  28.19 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.41 
 
 
245 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.41 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  25.79 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.41 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  32.34 
 
 
758 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.77 
 
 
207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.77 
 
 
242 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  31.62 
 
 
162 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.77 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  34.15 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.77 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  30.26 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.16 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.22 
 
 
234 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  30.12 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  28.32 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  34.06 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  30.57 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  31.71 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  28.08 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  25.53 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  30.94 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  26.38 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.86 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.08 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  25.59 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  29.89 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.88 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  23.21 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.79 
 
 
252 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 
558 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.2 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 
482 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  30.94 
 
 
151 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  21.96 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  22.14 
 
 
359 aa  63.5  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.72 
 
 
203 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.41 
 
 
355 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  26.03 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.89 
 
 
263 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.98 
 
 
483 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  26.53 
 
 
180 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  25.95 
 
 
485 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 
613 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  23.6 
 
 
561 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.82 
 
 
484 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  24.07 
 
 
558 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 
593 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  24.69 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  23.1 
 
 
439 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>