114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2621 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  50.31 
 
 
194 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  50.31 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  48.77 
 
 
189 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  51.25 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  51.25 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  39.6 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.29 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  41.25 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  36.94 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  40.34 
 
 
184 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.92 
 
 
219 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  41.73 
 
 
176 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  41.73 
 
 
176 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  37.64 
 
 
186 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  34.76 
 
 
758 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  38.36 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  35.93 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.06 
 
 
205 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  34.78 
 
 
162 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.49 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  33.18 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.39 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.86 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.13 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  34.13 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  30.32 
 
 
169 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  30.92 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.13 
 
 
242 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.13 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  33.56 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  31.11 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.75 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  29.51 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  29.3 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  32.6 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.45 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  30.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  30.56 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  37.8 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.03 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  35.66 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  32.31 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.83 
 
 
386 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.21 
 
 
363 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  31.09 
 
 
234 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.32 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.32 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.62 
 
 
349 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.51 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  33.33 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.17 
 
 
355 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.49 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.63 
 
 
366 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  28.06 
 
 
481 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  27.04 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 
487 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  27.57 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  36.36 
 
 
558 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  39.66 
 
 
715 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  24.71 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  33.07 
 
 
424 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  33.07 
 
 
424 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  28.21 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  33.07 
 
 
424 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  34.51 
 
 
424 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  30.77 
 
 
561 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  29.57 
 
 
311 aa  49.3  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.79 
 
 
389 aa  48.9  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  36.67 
 
 
659 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.23 
 
 
484 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  33.63 
 
 
424 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
300 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  37.93 
 
 
569 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  26.45 
 
 
417 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1112  hypothetical protein  24.58 
 
 
479 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  30.51 
 
 
439 aa  46.2  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  36.67 
 
 
548 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  30.17 
 
 
356 aa  45.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.66 
 
 
586 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  33.72 
 
 
482 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  25.6 
 
 
448 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2883  cardiolipin synthetase  30.14 
 
 
408 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
472 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.99 
 
 
551 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0889  phospholipase D/transphosphatidylase  29.17 
 
 
408 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  30.11 
 
 
461 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  29.58 
 
 
401 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>