39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3425 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1173    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  34.19 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  34.2 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  33.05 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  27.64 
 
 		 715 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  28.23 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 		 597 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  28.04 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  27.52 
 
 		 593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.14 
 
 		 590 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 600 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  27.4 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.46 
 
 		 591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  27.11 
 
 		 601 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  27.11 
 
 		 601 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  26.95 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  26.95 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  26.95 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  26.95 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  24.29 
 
 		 566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  24.34 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  24.34 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  24.78 
 
 		 575 aa  97.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  24.55 
 
 		 575 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  23.15 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  33.96 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  23.65 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  46.3 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  46.3 
 
 		 189 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  22.91 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  40.3 
 
 		 189 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  37.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.5 
 
 		 481 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  34.33 
 
 		 184 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>