52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3340 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 575 aa  1182    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  53.67 
 
 		 575 aa  621  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  49.57 
 
 		 585 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  35.33 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  31 
 
 		 589 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  31 
 
 		 589 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.59 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 		 593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 		 593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.02 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  26.43 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  24.88 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  24.88 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.51 
 
 		 591 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 597 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  25.25 
 
 		 613 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.73 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  24.55 
 
 		 569 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  42.5 
 
 		 165 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.35 
 
 		 600 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  24.87 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  23.34 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.28 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.23 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  24.74 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  24.74 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  24.74 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  24.74 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  24.74 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  24.74 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.63 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.96 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  22.25 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  24.48 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  36.78 
 
 		 659 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  25.43 
 
 		 260 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.37 
 
 		 545 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  26.55 
 
 		 176 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  24.73 
 
 		 543 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  26.55 
 
 		 472 aa  54.3  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  24.84 
 
 		 183 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  25.27 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  26.1 
 
 		 545 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.1 
 
 		 545 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  24.18 
 
 		 169 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.95 
 
 		 392 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  25.49 
 
 		 193 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.19 
 
 		 404 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  40.74 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 528 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  38.46 
 
 		 175 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>