41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2486 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1191    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  49.66 
 
 
575 aa  551  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  49.57 
 
 
575 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  35.1 
 
 
566 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  30.16 
 
 
589 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  30.16 
 
 
589 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
613 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.77 
 
 
590 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  27.68 
 
 
598 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  27.68 
 
 
598 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  28.47 
 
 
591 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  27.5 
 
 
598 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  28.32 
 
 
600 aa  111  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 
601 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  29.05 
 
 
601 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 
593 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 
593 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  25.27 
 
 
548 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  25.57 
 
 
715 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  22.01 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  35.86 
 
 
165 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  26.9 
 
 
558 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  24.81 
 
 
575 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  23.65 
 
 
569 aa  64.3  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  25.52 
 
 
659 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  24.71 
 
 
393 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.44 
 
 
376 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.9 
 
 
363 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  40.74 
 
 
184 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  35.21 
 
 
545 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  34.25 
 
 
528 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  35.21 
 
 
545 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 
545 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.43 
 
 
472 aa  43.5  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>