33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1178    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  35.33 
 
 		 575 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  34.62 
 
 		 575 aa  330  4e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  35.02 
 
 		 589 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  35.02 
 
 		 589 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  35.1 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.68 
 
 		 548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  26.19 
 
 		 593 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.89 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  26.47 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.19 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 		 598 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  25.49 
 
 		 597 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  25.53 
 
 		 601 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  24.29 
 
 		 569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  25.45 
 
 		 593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  25.35 
 
 		 601 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  25.35 
 
 		 601 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  25.35 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  25.35 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  25.35 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  25.35 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.18 
 
 		 600 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  45.04 
 
 		 165 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  23 
 
 		 561 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  24.37 
 
 		 558 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  22.83 
 
 		 575 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  21.86 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  26.85 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  29.41 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>