129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0396 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
472 aa  971    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  58.97 
 
 
467 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  46.94 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  43.94 
 
 
545 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.53 
 
 
545 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  43.72 
 
 
545 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  41.34 
 
 
543 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  64.62 
 
 
260 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.5 
 
 
585 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  43.02 
 
 
528 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 
481 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  33.26 
 
 
487 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02891  hypothetical protein  78.67 
 
 
75 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.294183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 
376 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.18 
 
 
404 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  26.61 
 
 
393 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.31 
 
 
386 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2290  hypothetical protein  53.25 
 
 
92 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.670591  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.93 
 
 
363 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  25 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.63 
 
 
196 aa  81.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.39 
 
 
536 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.37 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.68 
 
 
175 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02781  hypothetical protein  71.74 
 
 
56 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.12 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 
556 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  24.42 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  31.65 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.17 
 
 
590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.39 
 
 
551 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.22 
 
 
230 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  27.91 
 
 
176 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  27.91 
 
 
176 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  27.95 
 
 
598 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  28.06 
 
 
177 aa  64.7  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  29.11 
 
 
593 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  28.47 
 
 
601 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 
597 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  26.35 
 
 
151 aa  63.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  24.07 
 
 
620 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  25.39 
 
 
389 aa  61.6  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  23.2 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  25.5 
 
 
591 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  21.71 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  22.68 
 
 
311 aa  60.1  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  28.42 
 
 
613 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  19.59 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  29.31 
 
 
600 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  26.9 
 
 
206 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  23.97 
 
 
358 aa  58.2  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.67 
 
 
198 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.35 
 
 
234 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  26.04 
 
 
203 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.55 
 
 
575 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  28.97 
 
 
176 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  21.99 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.54 
 
 
219 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  23.65 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  21.94 
 
 
561 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.59 
 
 
586 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  24.22 
 
 
282 aa  50.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.71 
 
 
247 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.53 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.77 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  28.23 
 
 
208 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 
234 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.03 
 
 
622 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.88 
 
 
194 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  29.03 
 
 
176 aa  47.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  39.71 
 
 
553 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.81 
 
 
162 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  27.42 
 
 
189 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.72 
 
 
593 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  47.06 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  47.06 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  53.49 
 
 
541 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  48 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.89 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  41.51 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.12 
 
 
205 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  47.06 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  47.06 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  46.15 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  47.06 
 
 
550 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  47.06 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  20.37 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  53.49 
 
 
549 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  25 
 
 
184 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  26.75 
 
 
186 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  51.16 
 
 
540 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  33.57 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  33.57 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>