100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2448 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 558 aa  1128    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  56.17 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.12 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  45.47 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  44.4 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.52 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 		 622 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.38 
 
 		 536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  32.26 
 
 		 620 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.31 
 
 		 611 aa  134  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.61 
 
 		 534 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.21 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.06 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.51 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  25 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  24.25 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  25.19 
 
 		 961 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  26.42 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  22.85 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.15 
 
 		 349 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  23.53 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.06 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.19 
 
 		 585 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  25.9 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  23.27 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  26.42 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  23.65 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  21.75 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  38.38 
 
 		 186 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.3 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  28.97 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.61 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.6 
 
 		 484 aa  54.3  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 		 479 aa  53.5  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  35.76 
 
 		 180 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  29.7 
 
 		 183 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  29.05 
 
 		 175 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  28.57 
 
 		 440 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  29.7 
 
 		 169 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  23.47 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  23 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  33.03 
 
 		 176 aa  50.4  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  33.03 
 
 		 176 aa  50.4  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  31.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  28.95 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  31.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  23.68 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.81 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 		 196 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.57 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.86 
 
 		 162 aa  47.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  29.01 
 
 		 180 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  23.98 
 
 		 299 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  23.98 
 
 		 299 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.41 
 
 		 198 aa  47  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 		 192 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.38 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.93 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  22.99 
 
 		 458 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  33.53 
 
 		 359 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  26.23 
 
 		 176 aa  46.6  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  28.65 
 
 		 183 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  28.76 
 
 		 190 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  24.2 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  30.97 
 
 		 176 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  28.57 
 
 		 196 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.99 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.23 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.25 
 
 		 242 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  22.85 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1011  hypothetical protein  26.58 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.62 
 
 		 487 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.25 
 
 		 207 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.46 
 
 		 242 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.84 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  23.53 
 
 		 401 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.46 
 
 		 207 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  24.27 
 
 		 419 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  26 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.82 
 
 		 385 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  24.09 
 
 		 477 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.11 
 
 		 487 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 		 487 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  32 
 
 		 234 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  28.21 
 
 		 758 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  23.26 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 		 478 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  18.99 
 
 		 358 aa  43.9  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>