55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3012 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  66.83 
 
 		 600 aa  798    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  67.73 
 
 		 601 aa  805    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  68.06 
 
 		 601 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  67.73 
 
 		 601 aa  805    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  71.84 
 
 		 598 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  67.89 
 
 		 601 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  71.26 
 
 		 593 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  92.39 
 
 		 590 aa  1117    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  71.84 
 
 		 598 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  67.73 
 
 		 601 aa  805    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1219    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  71.26 
 
 		 593 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  71.96 
 
 		 597 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  67.89 
 
 		 601 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  71.5 
 
 		 598 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  67.73 
 
 		 601 aa  805    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  72.84 
 
 		 613 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.8 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  27.63 
 
 		 561 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  27.07 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  26.82 
 
 		 569 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  28.81 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  28.75 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  27.08 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  26.05 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.52 
 
 		 715 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  27.3 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  27.3 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  28.28 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  25.85 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  39.56 
 
 		 165 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.09 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.45 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  26.95 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  24.91 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  24.57 
 
 		 545 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  26.44 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.83 
 
 		 363 aa  57  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.26 
 
 		 585 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.21 
 
 		 376 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  22.03 
 
 		 286 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  21.68 
 
 		 286 aa  50.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  23.47 
 
 		 189 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.26 
 
 		 196 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  23.47 
 
 		 194 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.75 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  20.45 
 
 		 234 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  29.92 
 
 		 184 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  41.38 
 
 		 177 aa  44.3  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.19 
 
 		 392 aa  43.9  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>