32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04805 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  80.6 
 
 		 589 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  80.6 
 
 		 589 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  45.11 
 
 		 566 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  42.98 
 
 		 575 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  35.81 
 
 		 585 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  34.92 
 
 		 575 aa  80.9  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  40.21 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  39.18 
 
 		 598 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  39.18 
 
 		 598 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 597 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  42.39 
 
 		 613 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  40.22 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  38.04 
 
 		 593 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.4 
 
 		 590 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  35.96 
 
 		 591 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  33.05 
 
 		 601 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  33.96 
 
 		 569 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  36.36 
 
 		 601 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 600 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  28.78 
 
 		 548 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  32.38 
 
 		 558 aa  54.3  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  25.78 
 
 		 561 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  35.38 
 
 		 575 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  30.21 
 
 		 659 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  35.59 
 
 		 545 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  35.59 
 
 		 545 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>