49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3095 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1131    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  33.05 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  31.29 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  29.41 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 		 601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  29.21 
 
 		 593 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.79 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  28.97 
 
 		 601 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  28.97 
 
 		 601 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  28.97 
 
 		 601 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  28.97 
 
 		 601 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  28.97 
 
 		 601 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 601 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  27.26 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  28.64 
 
 		 598 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  28.64 
 
 		 598 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  28.64 
 
 		 613 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  27.8 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 		 593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  28.36 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  28.59 
 
 		 598 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  27.68 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  26.39 
 
 		 589 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  26.39 
 
 		 589 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  28.69 
 
 		 715 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  25.5 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  25.41 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  25.27 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  28.27 
 
 		 659 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.86 
 
 		 386 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  33.12 
 
 		 189 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  32.7 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  24.19 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  26.18 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.26 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  44.9 
 
 		 189 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  27.34 
 
 		 177 aa  50.1  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  27.74 
 
 		 175 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 363 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  36.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  25.95 
 
 		 196 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  39.68 
 
 		 528 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  21.65 
 
 		 487 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  40.98 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  26.76 
 
 		 162 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.89 
 
 		 481 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>