98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0302 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
479 aa  974    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  50.34 
 
 
528 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  49.43 
 
 
543 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  46.88 
 
 
545 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  44.82 
 
 
545 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  47.55 
 
 
545 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.15 
 
 
585 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  46.94 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  43.82 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  47.49 
 
 
260 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.95 
 
 
487 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.37 
 
 
363 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.21 
 
 
376 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.04 
 
 
386 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  26.34 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  24.87 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.41 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.57 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  28.91 
 
 
597 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  29.49 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
601 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  30.86 
 
 
175 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
613 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.15 
 
 
590 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02891  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.294183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.09 
 
 
229 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  28.62 
 
 
601 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  28.28 
 
 
600 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  28.62 
 
 
601 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  28.62 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  26.74 
 
 
230 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  28.62 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  28.62 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  28.62 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  27.03 
 
 
230 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  22.76 
 
 
286 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  19.39 
 
 
300 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.17 
 
 
591 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 
556 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  23 
 
 
536 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  25.85 
 
 
234 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  21.66 
 
 
177 aa  56.6  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  26.14 
 
 
176 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  26.14 
 
 
176 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  22.3 
 
 
196 aa  53.5  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  23.68 
 
 
184 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.53 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 
558 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  25.27 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  21.4 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  23.22 
 
 
448 aa  50.8  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.7 
 
 
247 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  22.67 
 
 
389 aa  50.1  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  22.78 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  25.28 
 
 
184 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  26.9 
 
 
242 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.9 
 
 
207 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.57 
 
 
198 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  26.63 
 
 
206 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 
484 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  24.58 
 
 
176 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  27.03 
 
 
758 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  38.96 
 
 
267 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  23.89 
 
 
311 aa  46.6  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.21 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  22.94 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.14 
 
 
207 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  26.21 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.21 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  22.75 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.61 
 
 
263 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  24.93 
 
 
620 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  36 
 
 
575 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.14 
 
 
245 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 
180 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3602  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 
257 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0836596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  24.68 
 
 
569 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  29.14 
 
 
208 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  22.16 
 
 
575 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.84 
 
 
349 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2290  hypothetical protein  38.18 
 
 
92 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.670591  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  23.85 
 
 
176 aa  43.9  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  37.29 
 
 
585 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  25.41 
 
 
522 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  40.98 
 
 
548 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  31.33 
 
 
192 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  24.81 
 
 
151 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  23.24 
 
 
176 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>