254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0213 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  53.96 
 
 		 180 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  51.88 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.25 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  28.95 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  32.05 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  32.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  32.28 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  33.14 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.07 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  28.67 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  26.74 
 
 		 518 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  31.03 
 
 		 481 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.86 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  32.38 
 
 		 477 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  31.25 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  29.93 
 
 		 484 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  29.8 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  35.5 
 
 		 502 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  29.8 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  32 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  31.41 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.78 
 
 		 395 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  31.76 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 		 532 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.56 
 
 		 392 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.48 
 
 		 477 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.84 
 
 		 395 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  27.44 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.76 
 
 		 384 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  33.64 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.82 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  32.31 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 439 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  33.83 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  28.36 
 
 		 474 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.91 
 
 		 462 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  29.52 
 
 		 480 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.31 
 
 		 472 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.83 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 		 453 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 396 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  32.79 
 
 		 758 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  32.31 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.37 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  40.82 
 
 		 543 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.3 
 
 		 489 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.74 
 
 		 464 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  24.09 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  31.54 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.84 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.74 
 
 		 464 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.37 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.84 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.62 
 
 		 481 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.58 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.02 
 
 		 458 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.84 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  33.67 
 
 		 486 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.84 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  28.21 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  28.21 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  31.47 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 486 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  26.28 
 
 		 486 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  30.43 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 		 534 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  26.28 
 
 		 486 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  26.28 
 
 		 486 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  30.3 
 
 		 492 aa  47.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  31.03 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  31.73 
 
 		 555 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  32.31 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  28 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>