149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1105 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  90.13 
 
 
242 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  92.86 
 
 
245 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  99.03 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  98.07 
 
 
207 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  92.75 
 
 
207 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  68.97 
 
 
223 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  70.81 
 
 
207 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  70.81 
 
 
223 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  61.04 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  45.91 
 
 
219 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  59.6 
 
 
169 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  58.94 
 
 
183 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  47.22 
 
 
183 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  48.39 
 
 
193 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  49.39 
 
 
176 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  50.62 
 
 
205 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  50.98 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  49.06 
 
 
175 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  41.25 
 
 
213 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  41.25 
 
 
213 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  42.14 
 
 
203 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  41.35 
 
 
177 aa  116  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  41.96 
 
 
758 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  38.75 
 
 
189 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  41.01 
 
 
176 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  41.01 
 
 
176 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  38.75 
 
 
194 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  38.85 
 
 
162 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  37.96 
 
 
184 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 
234 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  40.14 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  34.03 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  36.54 
 
 
189 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.91 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  39.01 
 
 
184 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  35.86 
 
 
203 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  33.33 
 
 
197 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.47 
 
 
196 aa  88.6  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  38.31 
 
 
190 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.55 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  39.05 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  38.16 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  33.33 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  35.2 
 
 
392 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.58 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.91 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.37 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  28.97 
 
 
359 aa  64.7  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  30.25 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  26.37 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.25 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  29.79 
 
 
487 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  25.56 
 
 
151 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  35.03 
 
 
404 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  28.31 
 
 
545 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.17 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.57 
 
 
349 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 
536 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  29.85 
 
 
439 aa  52.8  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.71 
 
 
474 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  30.22 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.59 
 
 
383 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  29.22 
 
 
556 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  27.71 
 
 
545 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  29.6 
 
 
389 aa  50.8  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  35.19 
 
 
477 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.32 
 
 
484 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  28.76 
 
 
559 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  32.84 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.8 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  26.21 
 
 
394 aa  49.3  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.1 
 
 
366 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.46 
 
 
551 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  30.34 
 
 
206 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  31.4 
 
 
299 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.51 
 
 
476 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.07 
 
 
622 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  30.49 
 
 
446 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7368  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  48.94 
 
 
52 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  42.62 
 
 
575 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  28.47 
 
 
620 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  25 
 
 
467 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  29.7 
 
 
550 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  31.3 
 
 
300 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  35.51 
 
 
476 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>