181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2108 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  40.11 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.1 
 
 
213 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  35.1 
 
 
213 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  35.47 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  34.46 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  37.04 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 
404 aa  93.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  32.14 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  34.13 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.44 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  35.2 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  33.54 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  33.54 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  37.28 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.05 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  29.94 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  31.45 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  30.77 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  37.04 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  37.5 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  29.63 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  31.58 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  33.33 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  33.33 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.06 
 
 
252 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  37.41 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.84 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  30.36 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.84 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.84 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.77 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.77 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.77 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  32.67 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  36.73 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  30.19 
 
 
393 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.23 
 
 
363 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  34.13 
 
 
376 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.88 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.05 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.52 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.19 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.97 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  31.17 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.79 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  30.6 
 
 
758 aa  64.7  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.52 
 
 
349 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.55 
 
 
234 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  34.07 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  32.09 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  35.4 
 
 
486 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  21.92 
 
 
286 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.25 
 
 
355 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  29.32 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.63 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  31.21 
 
 
203 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  30.6 
 
 
300 aa  55.1  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  32.03 
 
 
359 aa  54.3  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 
487 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.04 
 
 
487 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.82 
 
 
487 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  30.7 
 
 
492 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  30.7 
 
 
491 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.65 
 
 
420 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.87 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 
481 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  23.91 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  32.3 
 
 
470 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  24.64 
 
 
230 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  28.39 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  29.37 
 
 
482 aa  51.2  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
528 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  25.83 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.88 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
463 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  32.46 
 
 
490 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.14 
 
 
263 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.03 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 
470 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  27.61 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  32.74 
 
 
486 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 
487 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  30.89 
 
 
448 aa  49.3  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  32.74 
 
 
486 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 
485 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.83 
 
 
484 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 
516 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  27.21 
 
 
485 aa  48.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>