160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1930 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  61.18 
 
 		 223 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  58.76 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  58.76 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  62.34 
 
 		 245 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  61.69 
 
 		 242 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  61.69 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  59.63 
 
 		 207 aa  200  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  59.63 
 
 		 207 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  59.63 
 
 		 207 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  61.04 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  59.06 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  59.73 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  47.93 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  47.31 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  45.29 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  45.58 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  50.64 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  48.57 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  40.22 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  37.93 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  33.33 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  37.32 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  37.32 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  37.33 
 
 		 758 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  33.52 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  35.29 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  32.5 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  40.4 
 
 		 208 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  35.92 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  35.32 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.54 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  35.81 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  35.81 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  34.94 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  32.89 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  32.89 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  35.17 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.1 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  29.3 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.71 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.09 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.88 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  29.45 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  28.65 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.14 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  26.32 
 
 		 487 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.29 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  30.54 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  30.66 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  29.69 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.86 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  30.73 
 
 		 260 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  31.86 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.63 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  24.09 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.68 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.82 
 
 		 585 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1559  hypothetical protein  48.15 
 
 		 101 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.443609  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  26.51 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.22 
 
 		 560 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.89 
 
 		 622 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.62 
 
 		 474 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  37.63 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  26.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  27.27 
 
 		 545 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  30.66 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 		 478 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  28.57 
 
 		 299 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.93 
 
 		 536 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  30.12 
 
 		 486 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  28.57 
 
 		 299 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  29.03 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  28.69 
 
 		 389 aa  47.8  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.78 
 
 		 476 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 		 478 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.23 
 
 		 528 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  31.48 
 
 		 477 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1603  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 		 396 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.113302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 558 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.67 
 
 		 545 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  31.63 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  31.86 
 
 		 439 aa  46.2  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  29.52 
 
 		 486 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.78 
 
 		 476 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.91 
 
 		 430 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.45 
 
 		 551 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>