More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1603 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1603  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 396 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.113302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.6 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 		 486 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.29 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  30.11 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.4 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.63 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  30.73 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  31.46 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.87 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  31 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  31.4 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  32.63 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  32.75 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.64 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.07 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  32.57 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  32.3 
 
 		 401 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.2 
 
 		 485 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  30.92 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.49 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  29.63 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  30.18 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.09 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  29.06 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.92 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  31.59 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.92 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  30.54 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  29.49 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  30.34 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  31.41 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.92 
 
 		 509 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.71 
 
 		 477 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.52 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  30.54 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  30.03 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  29.06 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  29.97 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  34.04 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.3 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.04 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  30.27 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  29.26 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  31.48 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  30.27 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.97 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.68 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  30.27 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.59 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 		 514 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 479 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.65 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  28.61 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.09 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.27 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  29.49 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  30.57 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.14 
 
 		 481 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  30.92 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  27.87 
 
 		 479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  29.7 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.04 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 		 474 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3607  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000824683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.89 
 
 		 462 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 		 483 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  28.9 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  30.24 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.86 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>