More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2237 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
363 aa  733    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  52.76 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  37.01 
 
 
376 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  35.05 
 
 
404 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  36.9 
 
 
393 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.95 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.31 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.06 
 
 
545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  27.37 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  39.42 
 
 
230 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  40.15 
 
 
230 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  44.83 
 
 
175 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 
472 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  39.29 
 
 
196 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 
528 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.9 
 
 
229 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  43.51 
 
 
213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  43.51 
 
 
213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.62 
 
 
543 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  23.45 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  40.15 
 
 
184 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  23.88 
 
 
467 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.48 
 
 
196 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  28.51 
 
 
286 aa  92.8  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  37.91 
 
 
183 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  36.72 
 
 
203 aa  90.9  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 
286 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  37.25 
 
 
169 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  44.04 
 
 
234 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  23.43 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  39.44 
 
 
176 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.23 
 
 
176 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.84 
 
 
198 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  39.86 
 
 
162 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.24 
 
 
585 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  39.58 
 
 
245 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  39.58 
 
 
207 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  39.58 
 
 
207 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  39.58 
 
 
242 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.91 
 
 
242 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  39.58 
 
 
207 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  31.91 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.91 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  44.36 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  45.11 
 
 
188 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  36.73 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  37.41 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  36.3 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  37.5 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  33.54 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  35.86 
 
 
176 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  35.86 
 
 
176 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  32.85 
 
 
177 aa  81.3  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  35.71 
 
 
758 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.6 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  22.75 
 
 
545 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  38.84 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  24.76 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  33.57 
 
 
176 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  35.46 
 
 
197 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  26.89 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  26.27 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  39.52 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.76 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.67 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  38.71 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  37.91 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  26.46 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.24 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  37.9 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.17 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  23.65 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.54 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.22 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  37.5 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  33.82 
 
 
151 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  23.06 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  28.02 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  21.86 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.77 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  23.87 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  28.95 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  30.15 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  25.86 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  21.96 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  24.11 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  25.53 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  29.46 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.04 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  26.87 
 
 
492 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.56 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  32.77 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>