226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0808 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  100 
 
 		 446 aa  922    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  68.45 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  57.21 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  59.45 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  25.27 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.89 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  22.43 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.77 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.73 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.83 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.47 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.05 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  26.73 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.01 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  26.73 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  26.73 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  25.9 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  23.31 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.85 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.1 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  22.35 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.89 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.47 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.33 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  25.88 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.71 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  23.51 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  23.77 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  23.94 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  23.71 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.69 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.47 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  24.32 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  27.48 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.53 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  23.03 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.88 
 
 		 374 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  24.1 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.48 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.94 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  23.28 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  26.5 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  22.56 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  26.9 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.86 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.24 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.52 
 
 		 560 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 534 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  22.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  22.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  24.02 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  21.65 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.88 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  25.24 
 
 		 385 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  25.88 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.34 
 
 		 551 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  25.63 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  26.02 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.28 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  26.06 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  23.44 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.38 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  23.38 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  23.54 
 
 		 484 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  24.86 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  21.15 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.24 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  24.26 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.93 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.32 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  23.58 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.07 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.62 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  31.71 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  21.91 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  23.92 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.12 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  21.99 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.2 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3316  phospholipase D/transphosphatidylase  29.5 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.73 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  24.27 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  25.64 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>