77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1028 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  617  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  61.49 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  60.67 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  60.67 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.5 
 
 		 430 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.75 
 
 		 349 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  25.87 
 
 		 355 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  26.81 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.43 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.96 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3225  hypothetical protein  65.85 
 
 		 53 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2829  hypothetical protein  62.22 
 
 		 50 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.738513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  24.18 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26 
 
 		 536 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  26.71 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 558 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.33 
 
 		 481 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  26.06 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  23.12 
 
 		 556 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  30.15 
 
 		 481 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  26.34 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  30.51 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1112  hypothetical protein  29.71 
 
 		 479 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  26.71 
 
 		 397 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.86 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  26.43 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.4 
 
 		 397 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.87 
 
 		 459 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.71 
 
 		 478 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  24.85 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  24.48 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.43 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  28.29 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  23.29 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.17 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.58 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  24.85 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 		 478 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.97 
 
 		 478 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  25.33 
 
 		 472 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  24.2 
 
 		 389 aa  46.6  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 		 480 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.34 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 		 478 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  24.48 
 
 		 416 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  32.54 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  27.35 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  27.15 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  27.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  26.5 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  27.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.67 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.52 
 
 		 586 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 474 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.02 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.33 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  29.09 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  25.4 
 
 		 491 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.06 
 
 		 472 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  29.87 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  22.44 
 
 		 484 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 785 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.451  normal  0.0546669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.68 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  25.78 
 
 		 490 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 		 474 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 		 396 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>