18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1112 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  971    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2282  hypothetical protein  31.47 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.430872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2273  phospholipase D endonuclease domain-containing protein  28.82 
 
 		 473 aa  236  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  24.66 
 
 		 558 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.82 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  24.14 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  24.58 
 
 		 197 aa  46.6  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  29.02 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  23.79 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  24.82 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  24.1 
 
 		 196 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  25.71 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.78 
 
 		 526 aa  43.5  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.72 
 
 		 194 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  29.77 
 
 		 186 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  25.59 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>