130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0785 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  100 
 
 		 349 aa  692    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  72.96 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  76.28 
 
 		 353 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  72.75 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  25.75 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.15 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  23.53 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.99 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  24.83 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  24.83 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  36.07 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  36.07 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  33.97 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.45 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.9 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  23.63 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  24.15 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  30 
 
 		 162 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  25.32 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  30.17 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.6 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.6 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  31.62 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.78 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  35.66 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.48 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  34.88 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  27.67 
 
 		 550 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.93 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  29.41 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.93 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.64 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  29.2 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  29.38 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  28.82 
 
 		 758 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.57 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  31.68 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.58 
 
 		 196 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.58 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.57 
 
 		 207 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  29.57 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  30.43 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.57 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.93 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.71 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  27.05 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.49 
 
 		 534 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  25.79 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.54 
 
 		 536 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 451 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  26.67 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  29.71 
 
 		 169 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  26.89 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  29.01 
 
 		 180 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.86 
 
 		 219 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.02 
 
 		 551 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.01 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.82 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  20.68 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  28.99 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  24.39 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  27.81 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.83 
 
 		 203 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  29.77 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 		 191 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.16 
 
 		 560 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.03 
 
 		 488 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  31.53 
 
 		 486 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  25.95 
 
 		 961 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  30 
 
 		 151 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  31.53 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 		 191 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  22.13 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  23.45 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  26.77 
 
 		 532 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.26 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  27.61 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.93 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.91 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  29.82 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  27.41 
 
 		 483 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  27.61 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.07 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3068  phospholipase D/transphosphatidylase  24.44 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478794  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  29.81 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.68 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1918  cardiolipin synthetase domain protein  30.63 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>